Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Pde6aP27664 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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