Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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