Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Tsta3P23591 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tsta3P23591 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tsta3P23591 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tsta3P23591 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Tsta3P23591 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tsta3P23591 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tsta3P23591 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tsta3P23591 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tsta3P23591 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tsta3P23591 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tsta3P23591 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tsta3P23591 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tsta3P23591 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tsta3P23591 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tsta3P23591 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tsta3P23591 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tsta3P23591 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tsta3P23591 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tsta3P23591 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tsta3P23591 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tsta3P23591 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tsta3P23591 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms