Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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PdgfaP20033 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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PdgfaP20033 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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PdgfaP20033 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PdgfaP20033 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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