Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18532 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18532 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18532 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18532 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18532 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18532 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18532 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18532 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18532 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18532 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18532 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18532 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18532 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18532 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18532 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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