Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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