Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gata1P17679 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gata1P17679 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms