Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms