Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
DmdP11531 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ctse-201ENSMUST00000073350 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
DmdP11531 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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