Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfrbP05622 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms