Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DffaO54786 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DffaO54786 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DffaO54786 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DffaO54786 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DffaO54786 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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DffaO54786 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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DffaO54786 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DffaO54786 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DffaO54786 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms