Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edil3O35474 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edil3O35474 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms