Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Atf6bO35451 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Atf6bO35451 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Atf6bO35451 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Atf6bO35451 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Atf6bO35451 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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