Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Top3a-202ENSMUST00000102668 3542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Hrh1-203ENSMUST00000160780 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Ptpn5-202ENSMUST00000102626 3137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Fam221b-201ENSMUST00000056474 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm15398-202ENSMUST00000219998 1477 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 9330136K24Rik-201ENSMUST00000180842 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm29326-201ENSMUST00000185541 2451 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Unc45b-201ENSMUST00000018989 3549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Sh3tc1-207ENSMUST00000201511 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Nup107-201ENSMUST00000064848 3114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Nfam1-203ENSMUST00000109503 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Alox8-201ENSMUST00000021262 3226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Swt1-201ENSMUST00000064771 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm26710-201ENSMUST00000181265 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm42638-201ENSMUST00000196065 2587 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Uhrf1-204ENSMUST00000113039 3391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Thbs3-201ENSMUST00000029682 3190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm26773-201ENSMUST00000180772 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Tbccd1-201ENSMUST00000004576 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Lmx1a-202ENSMUST00000111377 3200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm15455-201ENSMUST00000117459 2557 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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