Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20939L7N243 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms