Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm2888K7N746 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm2888K7N746 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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