Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm7965-201ENSMUST00000211675 1105 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 2900045O20Rik-201ENSMUST00000218374 1292 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC159293.1-201ENSMUST00000222662 545 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr1043-201ENSMUST00000099907 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm438-201ENSMUST00000105746 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 1700108F19Rik-205ENSMUST00000190818 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Gm10608-201ENSMUST00000093527 2509 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Slc30a2-202ENSMUST00000105872 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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