Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2035J3QP87 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms