Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Taf4bG5E8Z2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms