Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ScaperF8VQ70 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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