Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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H2-M1F7CXU4 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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H2-M1F7CXU4 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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H2-M1F7CXU4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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H2-M1F7CXU4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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H2-M1F7CXU4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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H2-M1F7CXU4 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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H2-M1F7CXU4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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H2-M1F7CXU4 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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H2-M1F7CXU4 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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H2-M1F7CXU4 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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H2-M1F7CXU4 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-M1F7CXU4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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