Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28048F7BCN0 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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