Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cfap46E9Q2C0 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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