Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms