Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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