Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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PtprbB2RU80 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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