Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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