Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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PtprsB0V2N1 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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PtprsB0V2N1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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PtprsB0V2N1 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprsB0V2N1 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms