Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms