Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vamp5Q9Z2P8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms