Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pdpk1Q9Z2A0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms