Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms