Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rnf4Q9QZS2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rnf4Q9QZS2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rnf4Q9QZS2 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rnf4Q9QZS2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rnf4Q9QZS2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rnf4Q9QZS2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rnf4Q9QZS2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rnf4Q9QZS2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Rnf4Q9QZS2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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