Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms