Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Prg4Q9JM99 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Prg4Q9JM99 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Prg4Q9JM99 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Prg4Q9JM99 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Prg4Q9JM99 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Prg4Q9JM99 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Prg4Q9JM99 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Prg4Q9JM99 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prg4Q9JM99 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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