Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn5Q9JL35 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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