Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Mrpl39Q9JKF7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Mrpl39Q9JKF7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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