Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Rdh9-201ENSMUST00000052652 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Add2-210ENSMUST00000205034 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms