Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
MesdQ9ERE7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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MesdQ9ERE7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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MesdQ9ERE7 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MesdQ9ERE7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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