Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hmgn3Q9DCB1 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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