Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PmpcaQ9DC61 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms