Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syde1Q9DBZ9 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms