Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc97Q9DBT3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms