Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Smg9Q9DB90 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Smg9Q9DB90 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
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Smg9Q9DB90 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Smg9Q9DB90 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Smg9Q9DB90 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Smg9Q9DB90 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Smg9Q9DB90 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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