Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pdzd9Q9D9M4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pdzd9Q9D9M4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pdzd9Q9D9M4 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pdzd9Q9D9M4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pdzd9Q9D9M4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pdzd9Q9D9M4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pdzd9Q9D9M4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pdzd9Q9D9M4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pdzd9Q9D9M4 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pdzd9Q9D9M4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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