Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usp12Q9D9M2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms