Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf7l2-208ENSMUST00000111654 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Gtf3c6Q9D8P7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Gtf3c6Q9D8P7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Gtf3c6Q9D8P7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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