Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccdc83Q9D4V3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccdc83Q9D4V3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccdc83Q9D4V3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccdc83Q9D4V3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccdc83Q9D4V3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccdc83Q9D4V3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccdc83Q9D4V3 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccdc83Q9D4V3 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccdc83Q9D4V3 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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