Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Snx29Q9D3S3 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx29Q9D3S3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx29Q9D3S3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx29Q9D3S3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx29Q9D3S3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx29Q9D3S3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx29Q9D3S3 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx29Q9D3S3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx29Q9D3S3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx29Q9D3S3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snx29Q9D3S3 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms