Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms